Gépi tanulás segíthet a mikrobiális alapú rákdiagnosztika fejlesztésében

Diavitas Életmód Program logó
2020 október 01. Diavitas Magazin

Az elmúlt időben egyre több eredmény lát napvilágot, amelyben a humán mikrobiom szerepét tárják fel a daganatok kialakulásával és lefolyásával kapcsolatban. Mára már ismertek a mikrobiommal összefüggő, egészséget védő, illetve a rákkeltő vagy proliferációt kiváltó mechanizmusok. Ezek az ismeretek megnyitják az utat az új diagnosztikai eljárások felé is (Korábbi cikkünk: https://www.diavitas.hu/fusobacterium-nucleatum-mint-lokalisan-elorehaladott-vegbelrak-larc-biomarker/).

Egy, a közelmúltban a Nature-ben publikált vizsgálatban a Rákgenom Atlasz (The Cancer Genome Atlas) mintáin végzett kísérleteket mutatnak be, melyek azt vizsgálták, hogy a daganatos betegekben milyen mikrobiális jelek mutathatóak ki. A kutatás célja volt kimutatni azokat a non-humán, mikroorganizmus eredetű nukleinsav molekulákat daganat szövetből és vérből, melyek egy-egy tumor típushoz köthetőek. A kutatás során 10183 páciens 17625 szövetmintájából származó teljes genom szekvenálási és teljes transzkriptom szekvenálási eremdényt elemeztek. A minták 32 fajta, mintavételkor még kezeletlen daganatból származtak, forrásuk szilárd (szolid) szövetek és vér volt. Az emberi szövetből származó genetikai minták 7,2%-a nem humán, 2,5%-a mikroorganizmus (baktérium, archea vagy vírus) eredetű volt. A vizsgálat utóbbi, mikrobiális jelek elemzését célozta.

Kérjok, hogy a cikkünk teljes anyagát olvassa ide kattintva tovább.